Mới đây, Chi cục Thuế khu vực II đã ban hành Công văn 96/CCTKV.II-TTHT ngày 18/3/2025, hướng dẫn quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) năm 2024. Theo đó, các doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý nắm bắt thông tin kịp thời để thực hiện kê khai thuế TNDN đúng quy định, tránh các lỗi sai dẫn đến việc nộp thuế bị chậm trễ.

Ban hành Công văn 96/CCTKV.II-TTHT: Hướng dẫn quyết toán thuế TNDN.

I. Đối tượng áp dụng 

Công văn 96/CCTKV.II-TTHT được gửi đến cho các doanh nghiệp, tổ chức trên địa bàn Thành phố Hồ Chí Minh nhằm mục đích hỗ trợ doanh nghiệp, tổ chức trên địa bàn Thành phố Hồ Chí Minh thực hiện quyết toán thuế TNDN năm 2024 theo đúng quy định của Pháp luật.

Bên cạnh đó, Công văn 96/CCTKV.II-TTHT cũng là văn bản hướng dẫn giúp nhiều doanh nghiệp, tổ chức tại các địa bàn khác tham khảo và thực hiện quyết toán thuế TNDN.

II. Các nội dung chính cần lưu ý khi quyết toán thuế TNDN 2025 theo công văn 96/CCTKV.II-TTHT

Công văn 96/CCTKV.II-TTHT được ban hành căn cứ theo Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2008, Luật quản lý thuế 2019, Nghị định 132/2020/NĐ-CP, Nghị định 20/2025/NĐ-CP cùng nhiều văn bản pháp lý liên quan khác.

Tại công văn có các nội dung chính cần lưu ý như sau:

(1) Thời hạn nộp hồ sơ quyết toán thuế và nộp thuế

Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế:

• Đối với năm tài chính từ ngày 01/01/2024 đến ngày 31/12/2024 thì thời hạn nộp hồ sơ khai quyết toán thuế năm chậm nhất là ngày 31/3/2025.

Thời hạn nộp thuế:

• Thời hạn nộp thuế chậm nhất là ngày cuối cùng của thời hạn nộp hồ sơ khai thuế.

Lưu ý: Người nộp thuế không phải nộp hồ sơ khai thuế quý nhưng phải xác định số thuế tạm nộp hàng quý để nộp vào ngân sách nhà nước. Tổng số thuế TNDN đã tạm nộp của 04 quý không được thấp hơn 80% số thuế TNDN phải nộp theo quyết toán năm. Trường hợp người nộp thuế nộp thiếu so với số thuế phải tạm nộp 04 quý thì phải nộp tiền chậm nộp tính trên số thuế hộp thiều kể từ ngày tiếp sau ngày cuối cùng của thời hạn tạm nộp thuế thu nhập doanh nghiệp quý 04 đến ngày liền kề trước ngày nộp số thuế còn thiếu vào ngân sách nhà nước.

Thời hạn nộp hồ sơ quyết toán thuế TNDN chậm nhất là ngày 31/3.

(2) Hồ sơ quyết toán thuế TNDN cho kỳ tính thuế năm 2024

Tại Công văn 96/CCTKV.II-TTHT hướng dẫn chi tiết về hồ sơ quyết toán thuế TNDN cho kỳ tính thuế năm 2024 gồm có:

a)    Hồ sơ kê khai quyết toán thuế TNDN của người nộp thuế áp dụng đối với phương pháp doanh thu - chi phí, gồm:

 - Tờ khai quyết toán thuế TNDN (mẫu 03/TNDN) và một hoặc một số Phụ lục kèm theo tờ khai ban hành kèm theo Phụ lục II Thông tư 80/2021/TT-BTC và các Phụ lục thông tin về giao dịch liên kết theo các phụ lục đính kèm Nghị định 132/2020/NĐ-CP và Nghị định 20/2025/NĐ-CP (nếu có);

 - Báo cáo tài chính năm theo quy định của pháp luật về kế toán và pháp luật về kiểm toán độc lập (trừ trường hợp không phải lập báo cáo tài chính theo quy định).

b) Hồ sơ kê khai quyết toán thuế TNDN của người nộp thuế áp dụng đối với phương pháp tỷ lệ trên doanh thu, gồm:

 - Tờ khai thuế TNDN (mẫu 04/TNDN) ban hành kèm theo Phụ lục II Thông tư 80/2021/TT-BTC;

 - Báo cáo tài chính năm theo quy định của pháp luật về kế toán và pháp luật về kiểm toán độc lập (trừ trường hợp không phải lập báo cáo tài chính theo quy định).

Lưu ý hồ sơ quyết toán thuế TNDN năm 2024.

c) Đối với các doanh nghiệp có phát sinh giao dịch với các bên có quan hệ liên kết theo quy định tại Điều 5, Nghị định 132/2020/NĐ-CP (đã được sửa đổi, bổ sung tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP)thì nộp thêm:

 - Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết theo Phụ lục số 01 ban hành kèm theo Nghị định 20/2025/NĐ-CP; Phụ lục số 02, 03, 04 ban hành kèm theo Nghị định 132/2020/NĐ-CP.

 - Xác định chi phí lãi vay theo quy định tại Nghị định 132/2020/NĐ-CP (đã được sửa đổi, bổ sung tại Nghị định 20/2025/NĐ-CP):

Trường hợp, tại kỳ tính thuế TNDN năm 2020, năm 2021, năm 2022 và năm 2023 nếu doanh nghiệp đi vay thuộc:

 (1) Doanh nghiệp chỉ có quan hệ liên kết với tổ chức kinh tế hoạt động theo quy định của Luật Các tổ chức tín dụng quy định tại Điểm d, Khoản 2 Điều 5, Nghị định 132/2020/NĐ-CP.

 (2) Doanh nghiệp đi vay với bên cho vay hoặc bảo lãnh thuộc trường hợp quy định tại Điểm d.1 và Điểm d.2, Khoản 2, Điều 5, Nghị định 132/2020/NĐ-CP (được sửa đổi, bổ sung tại Điều 1, Nghị định 20/2025/NĐ-CP).

Hai trường hợp nêu trên có giao dịch liên kết thuộc phạm vi điều chỉnh tại Khoản 2, Điều 1, Nghị định 132/2020/NĐ-CP và có chi phí lãi vay không được trừ theo quy định tại Điểm a, Khoản 3, Điều 16, Nghị định 132/2020/NĐ-CP thì kể từ kỳ tính thuế năm 2024 thực hiện như sau:

• Trường hợp doanh nghiệp không có quan hệ liên kết và không phát sinh giao dịch liên kết theo quy định tại Nghị định 132/2020/NĐ-CP và Nghị định 20/2025/NĐ-CP thì phần chi phí lãi vay không được trừ và chưa được chuyển sang các kỳ tính thuế tiếp theo tỉnh đến cuối kỳ tính thuế năm 2023 được phân bổ đều chuyển sang các kỳ tính thuế tiếp theo cho thời gian còn lại theo quy định về thời gian được chuyển chi phí lãi vay tại Điểm b, Khoản 3, Điều 16, Nghị định 132/2020/NĐ-CP.
• Trường hợp doanh nghiệp có quan hệ liên kết và giao dịch liên kết theo quy định tại Nghị định 132/2020/NĐ-CP và Nghị định 20/2025/NĐ-CP thì chi phí lãi vay không được trừ và chưa được chuyển sang các kỳ tính thuế tiếp theo thực hiện theo quy định tại Điểm b, Khoản 3, Điều 16, Nghị định 132/2020/NĐ-CP.

Bên cạnh các nội dung về thời hạn nộp hồ sơ quyết toán thuế, thời hạn nộp thuế và thành phần hồ sơ thì Công 96/CCTKV.II-TTHT còn đưa ra các lưu ý khi kê khai tờ khai quyết toán thuế TNDN theo mẫu số 03/TNDN, đặc biệt nhấn mạnh căn cứ xác định doanh thu để tính thu nhập chịu thuế TNDN từ đó giúp doanh nghiệp, tổ chức tránh nhầm lẫn khi quyết toán thuế.

Công văn 96/CCTKV.II-TTHT được ban hành tại thời điểm cao điểm về quyết toán thuế TNDN, kịp thời, giúp các doanh nghiệp trên địa bàn Chi cục Thuế khu vực II thực hiện quyết toán thuế TNDN năm 2024 một cách chính xác, đầy đủ và tuân thủ đúng quy định pháp luật. Nắm vững và áp dụng các nội dung của công văn này không chỉ giúp doanh nghiệp, tổ chức tránh được các sai sót và rủi ro về thuế, mà còn góp phần nâng cao tính minh bạch và hiệu quả trong công tác quản lý tài chính.

Thu Hương